阿联酋艾因0-3科威特卡迪西亚(卡迪西亚总比分5-2晋级)

　　这场在艾因哈里发比-扎伊德体育场进行的比赛曾经被人认为是没有悬念，客场2-2逼平科迪西亚的艾因主场理应出线，最终没想到被对手大爆冷门，以0-3惨败。如果艾因进四强，他们将成为四届亚冠赛三进四强的球队，但现在只能看着对手卡迪西亚历史性地闯进亚冠四强，他们也是第一次打进亚冠四强的科威特球队。巴希尔在比赛中梅开二度，而穆巴拉克在终场前打进打进锁定胜局的一球。

　　客场逼平科威特人之后，艾因以为已经胜券在握，在开场打得也更加松散，反倒是背水一战的卡迪西亚更有气势，仅仅在第5分钟的时候，卡迪西亚射手穆塔瓦就进行了第一脚射门，对方后卫解围时犹豫，最终被门将萨利姆顽强扑出。但艾因后防线在第25分钟时又出现了严重问题，当时他们未能干净地封住卡迪西亚左路传球，被巴希尔将球钩进网内，卡迪西亚以两回合总比分3-2领先。

　　失望的上半场过后，艾因试图大举反攻，但攻击并未能很奏效，反倒是卡迪西亚的快速反击打得有声有色。第52分钟，卡迪西亚队长穆巴拉克主罚任意球几乎再次破门。之后艾因大举进入，第64分钟卡迪西亚的穆塔瓦几乎形成绝杀，但被对方门将萨利姆神奇扑救，这也使得艾因晋级希望尚存。

　　之后卡迪西亚又有几次有威胁的进攻机会，在第90分钟，巴希尔迅速出现在禁区内，打底角入网，梅开二度后也使得对方晋级无望。补时阶段，穆巴拉克锦上添花，接萨利赫完美传球再下一城，也彻底摧毁了阿联酋人的信心，而比赛最后一刻，艾因后卫朱马还因为对穆巴拉克的严重犯规而被红牌罚下，可谓是输球又输人。

　　沙特沙巴布0-1蔚山现代(蔚山现代总比分7-0晋级)

　　由于蔚山现代在主场的第一回合比赛中已经早早以6-0狂胜沙巴布，这场比赛也被认为是一场例行公事的比赛，朴东赫打进全场唯一入球之后，也使得亚冠半决赛变成了韩国人的内战。

　　比赛在利雅得的法哈德国王国际体育场举行，仅有可怜的2000人为主队助威，对于沙巴布来说，比赛也仅仅是为荣誉而战了，全场比赛也缺乏紧张的气氛。上半场比赛中，沙巴布曾经给蔚山现代造成一定威胁，但最终未能破门。下半场比赛开场仅仅5分钟，韩国人就获得了一次绝佳的机会，当时巴西外援莱昂纳多在右侧妙传，在点球区域埋伏的朴东赫接球后劲射破门，使得两回合比分已经达到7-0。此后沙巴布的马拉什曾经头球击中横梁，但最终未能扳平比分。

　　叙利亚卡拉马4-0沙特伊蒂哈德(卡拉马总比分4-2晋级)

　　比赛在叙利亚哈利德比-瓦利德体育场进行，伊蒂哈德已经在前两届亚冠赛上连续夺冠，这也是他们第三次连续冲击冠军，在亚足联官方的调查表上，认为伊蒂哈德最终会夺冠的支持率竟然将将50%，这场比赛也被认为是最没有悬念的比赛，伊蒂哈德被认为肯定晋级，但最终竟然爆冷在加时赛后0-4输球，这也是本轮最大的冷门。这场比赛绝对可以称得上是一场血战，全场比赛中竟然出现了1张红牌和7张黄牌，最终叙利亚人笑到了最后。

　　比赛开始后，已经有两球在手的伊蒂哈德打得比较松散，而弱小的卡拉马在主场迎战强大对手却并不示弱，给对手制造了一定的压力。而伊蒂哈德反倒在开局阶段打得相当拘谨，后卫卡里里在第8分钟就领得全场的第一张黄牌。第41分钟，卡拉马的伊拉德-曼多打进一球后将两回合比分扳成1-2，也使得主队看到了晋级的希望。几分钟之后，卡拉马获得点球机会，哈姆维射门后却被伊朗主裁判莫森指令重罚，重罚后被对方门将马布鲁克-扎伊德扑住。

　　然而在下半场刚开场3分钟的时候，卡拉马的奥梅尔在近角处晃过对方门将扎伊德打进一球，这一进球也将比分扳成2-2，而且双方主客场进球都完全一样。此后的42分钟之后双方都打进比较谨慎，也都未能进球，比赛最终被拖到残酷的加时赛阶段。第104分钟，加时赛第一阶段快结束的时候，伊布拉希姆在第11分钟时为全队打进金子一般的入球，而在第110分钟，伊布拉希姆梅开二度后也锁定了胜局。这样卡拉马就将在半决赛迎战科威特的卡迪西亚，这也是叙利亚和科威特的队伍首次进入亚冠半决赛。

　　韩国全北现代4-2上海申花(全北现代总比分4-3晋级)

　　主场先胜的上海申花客场只要逼平全北现代就可以晋级亚冠赛四场，但是在先进一球的情况下却被对手翻盘成功，2-4输球之后也以3-4的总比分被对手淘汰出局。比赛进行到第35分钟时，上海申花队利用快速反击机会由郜林打破僵局，场上比分变为1-0，上海申花队也以2-0的总比分领先，由于客场进球算两球，对方必须打进3球才能淘汰上海申花晋级。第37分钟，李玮峰由于向对手做出不必要的报复动作被红牌罚出场，之后上海申花后防线漏洞百出，先后被对手泽-卡洛打进2球，被廉基勋和郑钟冠各打进一球，全北现代队以4-1领先。三球落后的上海申花虽然由扬克尔在最后关头打进一球，但已经于事无补。

　　半决赛赛程

　　2006-09-27 叙利亚卡拉马VS科威特卡迪西亚

　　韩国全北现代VS蔚山现代

　　2006-10-18 科威特卡迪西亚VS叙利亚卡拉马

　　韩国蔚山现代VS全北现代