上赛季，汉军扮演了黑马角色，联赛第五，中超杯冠军。盛极必衰，本赛季武汉队下滑势头之猛出乎许多人意料，一度甚至跌落到保级圈中，排名仅仅在力帆之上。如果不是在客场战胜力帆，后来又在主场诡异的翻盘战胜亚泰，这才成功上岸。这个赛季对于武汉队来说，可以说是个失败的赛季。

　　成绩下滑，主教练裴恩才负一定的责任。尽管有内外援引进不力，伤病过多的原因，但不论是从球队的战术打法，乃至整体实力的提升上，武汉队不但没有提升，反而出现了下滑，这和主教练的执教不无关系。裴恩才一直在强调俱乐部没有引进内援，而放走了像马成这样的主力。实际上，让马成转会绿城，裴恩才是同意的，他当时表示，马成的离开不是因为实力问题，而是从全队的利益来考虑的。而在内援引进上，武汉队本来已经敲定了阎峰，最终也是裴恩才同意放他去亚泰。至于双森组合被拆分，因为两人只能留一个，俱乐部在征求教练组意见时，最终选择了吉奥森。因此这些都不能成为汉军成绩不佳的主要原因。就像队员所说，即使以目前汉军的人员配备，也不应该苦苦为保级而战。

　　上赛季7连胜时，裴恩才在临场指挥上屡屡有惊人之举，但本赛季却陷于平庸。像几个主场，汉军在换人时机、阵容调整上都显得极为被动，最终丧失了主动权，将胜利拱手让出。湖北足球圈内的几位人士在评价时认为，裴恩才所擅长的361阵型实际上存在着很大问题，特别是在几个位置上的轮转换位有先天不足。2004、2005赛季，武汉队中有多名八一队球员，他们对裴恩才的这套战术十分熟悉，运转起来当然顺畅。但这个赛季，大部分时间内几乎没有一名前八一球员，因此整个战术自然就打了折扣。而像定位球的防守等问题，整个赛季都没有解决好。

　　当然，当年在八一队以调教年轻球员闻名的裴恩才在这方面仍然眼光独到。本赛季，他大胆启用了像荣昊、邓卓翔等一批年轻球员，收到了不错的效果，同时有4名球员入选国青足以说明了这点。

　　本赛季武汉俱乐部高层也出现了震荡，担任总经理一职长达8年的陈旭东在世界杯期间突然提出辞职，尽管对外称身体不适，但实际上并非如此。因为他现在在武汉市城运会组委会上班，工作强度更大。有媒体称是由于联赛前半段战绩不佳，导致他下课。这种说法更是无稽之谈。因为就在他下课前的一场比赛，武汉队刚刚战胜了沈阳金德，结束了多轮不胜。陈旭东的离开是俱乐部高层权利斗争的结果。长期以来，陈旭东一直是集重权于一身，这早已引起了大股东的不满，而同时，俱乐部内部也有人对他的总经理位置虎视眈眈，最终陈旭东在两股总压之下离开，但总经理一职却由裴恩才兼任，此后又出现常务副总徐志强。俱乐部内部的混乱直接影响了球队的成绩。“陈旭东时代”的结束使得俱乐部权利分散化，有些方面甚至出现了真空，这必然会进一步导致俱乐部内部权利斗争的加剧。

　　在赛季结束之后，俱乐部也意识到为了避免外界的猜测，因此很快就宣布徐志强出任总经理，同时裴恩才也基本确定下赛季将继续出任主教练。同时，俱乐部也对内外援的引进、下赛季的名次有了初步构想。但是，要实现困难很大。尽管俱乐部的大股东是国企光谷投资，但由于受制于东湖开发区，投入俱乐部的资金情况并不理想。加上湖北企业热衷于足球的并不多，因此冠名权如何落实也是问题。没有资金的支持，俱乐部的这些想法近乎空想，特别是下赛季有两个降级名额，汉军的前途并不乐观。