遗憾一：无缘欧战进球榜首位

　　因扎吉的欧战生涯长达十数年，1995-1996赛季欧洲优胜者杯首轮帕尔马对阵阿尔巴尼亚球队图达杜利斯的比赛，因扎吉替补梅利登场，完成欧战首秀。而此后的17个赛季他15次出现在欧战赛场。总进球数累计到70球，2002-2003赛季更有欧冠16场12球的抢眼数据。但是超级皮波在2003至2005年为膝伤所累，职业生涯最后一季则被排除在欧冠名单之外，因此欧冠进球总数停留在70粒，无法突破劳尔保持的77球的最高纪录。

　　遗憾二：无缘欧洲杯冠军

　　因扎吉职业生涯的荣誉簿中包括意乙、意甲、意大利杯、意大利超级杯、托托杯、欧洲超级杯、欧冠、世俱杯、U21欧青赛以及世界杯的冠军，他缺少的最重要奖杯无疑是欧洲杯冠军。而2000年欧洲杯，因扎吉首发出战4场，小组赛对阵土耳其以及1/4决赛淘汰罗马尼亚的比赛收获进球，但决赛无缘登场的他只能眼睁睁看着法国完成奇迹逆转。

　　遗憾三：先后错失欧冠及丰田杯锦标


　　1997-1998赛季，因扎吉首次得到征战欧冠的机会，他为斑马军团出战10场，打进6球，其中包括1/4决赛客场对阵基辅迪纳摩时的帽子戏法，但1998年5月20日在阿姆斯特丹竞技场对阵皇马的决赛较量，尤文最终0-1不敌对手，齐达内+皮耶罗+因扎吉的前场三叉戟未能攻破银河战舰，米亚托维奇为皇马锁定胜局，而因扎吉两次错过得分良机。2003年的丰田杯决赛，因扎吉代表米兰出战博卡青年，他在第69分钟替补托马斯登场，加时赛阶段曾经打进一粒头球，但被判越位在先，最终米兰在点球大战中告负。

　　遗憾四：因伤无缘2004年欧洲杯

　　2004年的欧洲杯预选赛，因扎吉是意大利国家队的正印前锋，他帮助意大利以第9组头名（5胜2平1负，积17分位居小组第一，威尔士13分第二）轻松晋级决赛圈比赛，而超级皮波也以6粒进球力压皮耶罗成为蓝衫军的预选赛射手王，在总射手榜上仅次于斯洛文尼亚的西利亚克以及西班牙的劳尔。但他却因伤无缘最终的决赛圈较量，最终意大利小组末战被瑞典及丹麦做掉，最终无缘淘汰赛。